出了对黄、淮两河上、中、下游进行‘统行规划、源流并治’，可是清廷以为此策不可，徒费钱粮，引起朝中弹劾，以致于康熙不再信任靳公......”
有人的地方就有江湖，特别是在治理黄河这个大工程上面，自然也有无数人盯着，而靳辅作为河督，不可避免的受到了康熙的猜忌
实际上从康熙二十四年开始，靳辅与陈潢的决策就开始被朝廷反对，而在这其中最要命的就是康熙皇帝不再赞同靳陈二人的方法，他认为减水闸有益河工无益百姓，决定要将高邮、宝应等州县的减水坝泄出来的水引到海里，而这件事并不为靳辅所赞同，因此康熙便委任当时的安徽按察使于成龙主持
于成龙虽然号称是‘天下第一廉吏’，可是并非专业的治河人才，因此他主张疏浚海口以泄积水，可是在靳陈二人看来，下河海口高出内地五尺，疏海口引潮内浸，只会使得海水倒灌，危害更大，因此二人在治河上就已经开始发生了分歧
到了康熙二十四年十月的时候，康熙将二人一同召入了京城，会同九卿详加讨论，原本在第一次讨论的结果中，大家都认为靳辅是专业人士，而于成龙对河工未经阅历，应该采信内行的建议，然而并不为康熙所喜
后来众人揣测帝心之下，通政使参议成其范、给事中王又旦、御史钱珏等人开始支持于成龙，而礼部侍郎孙在丰又被委任为主持开下海，因此使得更多的人对靳辅展开了攻击，甚至工部还提出靳辅治河已经九年，未获成功，糜费钱粮，应交部里严加议处，只是被康熙暂时保下来了，但是从此靳辅便不再被康熙所信重
等到了康熙二十七年正月时，江南道御史郭琇上疏劾靳辅治河多年，一味偏信陈潢之言，今天议筑堤，明天议挑浚，浪费银钱数百万，没有终止之期，又指责他今天题河道，明天题河厅，以朝廷爵位为私恩，从未收到用人得当之效，甚至在最后还指责靳辅夺取民田，妄称屯垦，取米麦越境贩卖以谋私利
到了二月的时候，给事中刘楷又上疏劾靳辅用人不当，人浮于事，而御史陆祖修也劾靳辅‘积恶已盈’，认为康熙应该像舜杀了鲧一般杀了靳辅
一时间，靳辅成了众矢之的，被郭琇、刘楷、陆祖修、于成龙、慕天颜、孙在丰攻击，顿成风雨飘摇之势，而康熙也再一次召集了大学士和九卿讨论这件事，在这一次的会议当中，康熙彻底失去了对靳辅的信任，决定将靳辅革职，让福建总督王新命担任河道总督，而陈潢身上的佥事道衔亦被革去
陈定喃喃道：“家父并不以官位为重，可是他被革职之后，便再也无法同靳公治河，为山九仞，功亏一篑........在不久之后便已经仙去，只留下了《河防