经营西域凉、臧十二州遂平继伐汉中
十一月，天子出奔，自清明门东行，太尉刘虞在门前止之，伏地请归，尽言不可行，不听，再止，乃令矢之，中，然后匆匆之去三日，虞遗子和曰：“吾闻前卢子干死是谓子曰：‘勿以恶小而为之，勿以善小而不为’，深然之，吾今亦有言欲以遗子，曰：‘勿以时穷而忘节，勿以势起而乱性’，小子识之！”是夕疮发，薨，妾梅氏亦作炭殉矣天下议之，咸曰天子失德
十二月，天子既走南阳，关中动荡，士民皆望太祖归更有奏者，劝太祖进燕王位以安心太祖以汉高祖皇帝白马事，固辞之
同月，汉中太守张鲁孤身出斜道，降之乃令赵云进驻汉中，都督汉中、武都二郡，又发杨秋引千骑为辅，然使鲁为汉中太守汉中遂定
同月，太祖归长安，先为虞发葬
汉建安六年，元月，又令曹操、刘备及刘表请天子归长安详此事不应，反罪太祖
同月，百官再三请进燕公位，凡三辞，乃受，以燕公位代太子位行民主责，督十一州军政务并请于天子，且复请归
太祖既称公，乃尊母为燕国太后，敕封其妻为燕国后，其余诸位夫人皆称嫔拜汝南吕范为首相，魏郡审配为左相，南阳娄圭为右相，此三相下，又为四相，分为钜鹿田丰，北海王修，辽西韩当，颍川戏忠
设三省，一设中书省，掌机要，发政令，为首相领；再设尚书省，掌机要，统揽各部、台、曹、阁所入文书，批陈阅览，为左相领；后设门下省，掌机要，专司监察、批驳政令，为右相领三省之下，复设六部，曰礼部、吏部、工部、兵部、刑部、户部，每部皆有尚书一人，左右侍郎二人，直对各州郡县乡亭；又设十二寺，依旧属三省，曰太常寺、鸿胪寺、宗正寺、大理寺、少府寺、太仆寺、司农寺、将作寺、黄阁寺、版印寺、钦天寺、卫尉寺再设四台，曰御史台、财政台、枢密台、靖安台，御史台掌监察，为钜鹿田丰领，财政台掌财政，为北海王修所领，枢密台掌兵马调度，为辽西韩当所领，靖安台权责不明，但以颍川戏忠所领，郭嘉为副又曰，凡三省三相，与四台首脑，并于邺下铜雀台设坐，并称台僚，遇非常事，七座并论，可决国事！
三月，令蒋干使蜀，乃于彼见白罴，白罴者，祥瑞也
四月，后汉名臣赵歧夜观紫薇，谓左右曰：“苍天已死，昊天未立，岁在丙子，天下大吉！”
同月，操有战书予邺下，自称治军七十万，欲与太祖猎于白马太祖观之，复曰：“以吾之众旅，投鞭于河，足断其流”
五月，端午日，阅兵铜雀台，军容雄壮，咸曰万胜
同月，立射科取士策，即科举制也
同月，令徐晃、张颌奔袭白马，一战下之旋提邺下步骑一万