回报，便勾结各路海盗滋扰并劫掠葡萄牙的船只，甚至企图袭击澳门。
为了应对危机，在澳葡萄牙人紧急设防。不料此举竟引起大明当局的怀疑，以为葡萄牙人要图谋中国，便筑堡垒多个，并从各地调军严阵以待。
由于澳门地方耶稣会势力最大，而彼时在澳耶稣会又以郭居静为最尊，所以一时间谣言四起，称耶稣会士勾结葡萄牙人、荷兰人和倭国人，要杀光在澳的华人，然后用武力征服大明，并拥戴郭居静为皇帝。
在这时，有人散发了一本充满恶意诽谤的小说，诬称郭居静居心叵测，意欲谋篡帝位。现已约定联合倭人和南海诸岛夷共举大事。甚至说内地党羽甚多，只等战舰一到，即揭竿而起。如此流言汹汹，自然搞得人心惶惶，在澳华人纷纷避居内地。而在广州重镇，官兵也开始秣马厉兵，提高戒备，乃至造船备战。
时任两广总督戴耀一面调集军队，一面断绝与澳门葡人的贸易。澳门地方人多粮少，在海、陆双道同时遭阻的情况下，很快就出现了严重的粮荒。
为了平息事态，澳葡当局急忙派出一个“最为谦恭”的代表团，向戴耀表明绝无无入侵之事。代表团的斡旋与诚意，让戴耀看到了和平解决事态的希望。于是便向澳门派遣了一支调查团。
调查团在参观了全澳的教堂、旅店、医院等处，并召见郭居静本人前来说明情况之后，证实了并无备战造反迹象，才让中葡贸易恢复到正常状态。
因为战端未开，戴耀也有意粉饰太平，不想让京师以为他张皇无措、大惊小怪。所以到最后，这事儿也没在北京掀起太大的波澜。如果要去翻查案牍，可能只有兵部保留了一些模糊的备案记录。
但这对深涉事中的郭居静本人来说，就不是什么令人愉快的事情了。从广州过来的调查团说是召问，但实际上，这些人在确定了澳门没有聚兵之后立刻就把郭居静给抓了起来，甚至还极度粗暴地将他办公和住宿的地方给抄了。
所以郭居静听皇上前半句夸赞自己“髯长而美，身材魁梧”时，先是颇为自得的捋了捋自己那又长又白的胡子，但听后半句提到“万历三十四年”的时候，他的脸色一下子就变了，连捋胡子的手都停在了半空。
看出郭居静的慌乱，朱常洛才又笑道：“一些无关紧要的趣事而已，郭卿若是不想听，朕就不说了。让它过去吧。”
“谢圣上。”郭居静大松一口气。皇上金口玉言，说过去，那就真过去了。
“郭卿在耶稣会里有什么职，掌着什么事儿啊？”朱常洛问道。
“回皇上的话。耶稣会的总会在罗马，澳门的耶稣会只是总会下辖的一个分会，分会只设会长，其他人都没有教宗钦定的职务。”郭居静回答道：“臣原本计