初一，行营迁入大都城，赵昺在大明宫举行大朝会，召见文武众臣，同时下旨嘉奖有功，犒赏三军，大宴三天但他并没有久留大都，半月后任命江璆为河北、河南和山东制置使，兼领燕京府事
与此同时，开始布置撤军，第一军和炮一师驻留大都，戍守山南、山北诸州；第二军开赴真定镇守；第三军开赴长安镇守；第四军前往山东；第五军前往山西；第八军仍回襄樊；第十二军和十三军搭乘海船返回驻地
将开战后编成的十数个保安旅改编为边防军分赴宣德、开平、宁德等沿边重镇戍守第一水军留驻直沽，保卫海防和海运通路陆战队各自规建，工程师则负责在沿边修建戍堡，利用枯水季修通大运河至大都城内的运河布置完毕，行驾乘舟沿运河南下还都，至此第二次北伐胜利结束……
祥兴十九年，在赵昺主持下进行行政区域改革，大宋全境共重新规划为二十个省，一百余府、千余州（县），形成中央、省、府、州（县）四级行政管理机构
同年，赵昺下诏加强海贸，巩固旧有西洋航线外，利用新开辟环球航线，打入北美、北美市场同时在南北皇田试种引进的玉米、花生、番薯等新品种
祥兴二十年，赵昺着令兵部制定军事要地图谱，对禁军和州军进行整编，扩充骑军，加强边防军力经多番研讨后，保留八个军的禁军，炮军扩编为五个师，骑军十个师，水军保留大小舰船千艘，远征军得以继续保留作为战略支援军内地州军缩编为旅，编余兵力加强到边防军
调整后大宋保有禁军三十万、州军十万，边军二十万，共有兵力达六十万而后对诸部军将进行调整，江钲致仕，韩振接任枢密副使，一干禁军老将回京入枢密院任职，一大批青壮将领晋升各部主将
祥兴二十一年，赵昺任命降臣方臣祐为高丽招讨使，出动水、步军三万前往高丽李氏不敢交战请降，愿为大宋属国，降爵为王赵昺赐其为高丽王，以方臣祐为监政，长子入宋为质，年年纳贡
江南人口增长日益，耕地不足，赵昺下旨江浙人口北迁河北、河南，湖广人口充实川蜀；又迁山西之民前往陕甘宁地区将归附的蒙古人口安置在沿边，并置州县管理，将草场分与诸部，各部间不得相互侵扰
同年，皇长子赵璟至学龄，赵昺没有沿袭于宫中聘请帝师教育的旧例，而是让其入皇家学院学习此举引发轰动，京城子弟纷纷入院学习
祥兴二十二年，陆秀夫等老臣请辞致仕，赵昺以文天祥入主中书省、江璆支持尚书省，陈则翁入门下省，林之武、蔡乔、庄公从等人入京进入六部任职
赵昺下旨改临安为南京，燕京为北京，开始营造宫城，整修城垣
祥兴二十三年，赵昺北巡，驻跸开平府，调诸