疾的爆发低于台湾的其他地方，也正因为如此出现了台湾土著中唯一的一个政权——大肚番eyep○ org
而在大本营一开始的建设中，华人就占据了主导地位，所以华人的城市村镇都有完善的排水、排涝系统，极大减少了疟疾传播途径蚊虫的数量eyep○ org但是随着开垦的深入，大量的华人被迫离开相对安全整洁的城镇，进入潮湿闷热的丛林和沼泽地，让疟疾问题瞬间爆发eyep○ org
疾病带来的损伤，一度制约着社团的发展，毕竟每一个来自大陆的华人都是宝贵的技术力量eyep○ org即便他们不是铁匠，木匠等匠人，但相对于土著来说，男人都是经验丰富的农夫，女人也会缝纫裁剪等工作eyep○ org
疟疾问题从一开始得到了社团的重视，但是重视并不代表就能够解决eyep○ org李明勋从英国东印度公司那里获得了金鸡纳树的种子，金鸡纳树作为这个时代治疗疟疾的神药，一度让李明勋欣喜若狂，但是金鸡纳树需要成长七年才能够成熟，皮方可入药eyep○ org而青蒿虽然也能够治疗疟疾，但是效果并不是那么的明显eyep○ org
社团经过调查发现最容易得疟疾的工作是伐木和修建水利，特别是修建水利，工作地点主要在河流和沼泽地，那里蚊虫云集、环境恶劣，而伐木工人还可以通过台湾特产的樟脑熏蚊虫等方式防治eyep○ org
社团在防疫和治疗疾病方面没有建树，又必须扩张领地的情况下走向了另一个极端，那就是大量抓捕奴隶来进行危险性工作eyep○ org
世代居住在闷热潮湿的环境中的土著，他们对抗疟疾等热带亚热带疾病的能力远远超出了华人eyep○ org所以阿海命令赵三刀，尽量向北拓展，一则夺取土地，二则抓捕奴隶，而社团也通过与东南亚各个苏丹国的贸易，大量购入战争中捕捉的俘虏作为奴隶，编制成专门的奴隶营从事种植园开垦、水利建设、乃至矿山开采等活动eyep○ org虽然，仍旧有大量的人口在恶劣的环境中丧命，但是社团的损失却大大降低了eyep○ org
对于赵三刀和李山等人来说，这次交接已经结束了eyep○ org接替赵三刀的李珊将要继续执行赵三刀制定的开拓计划，抓捕奴隶的同时注意基隆港的西班牙人eyep○ org但是对李明勋来说，奴隶带来的问题才刚刚开始eyep○ org
社团的高层对于努力的态度是非常支持的，毕竟这种近乎免费的劳动力能够大大降低各部门的成本，但是奴隶并不只是男性劳动力，还有女奴，很显然对女奴拥有完全支配权的社团