一任尚书的人选，朱由栋选择了现任南洋总督陈时济：这一位，还在做县令的时候就靠近了当时的皇太孙，二十多年下来，履历和经验都足够丰富，忠诚度更是不用怀疑了kaxi6 ¤com
而陈时济调任后，原方山学子彭子勤则接任了中南总督的位置kaxi6 ¤com
户部是这一次被拆分得最多的kaxi6 ¤com第一任财政部尚书，朱由栋选择了曹三喜：这位一方面是银行行长的位置上待得太久，必须挪一挪kaxi6 ¤com另一方面，朱由栋深知自己大手大脚的毛病kaxi6 ¤com以前有个许弘纲时不时的顶一下他他还知道收敛，现在这个王绍徵软不拉几的，从来都是鼓励皇上多花钱——必须要让曹三喜这个更强硬的人来管国家的钱袋子，不然朕这会儿把钱花爽了，以后真要开全球大战，没钱的时候怎么办？
曹三喜从皇家银行离任后，出身于方山学校的数学家李国俊，则是去接了银行行长的位置——这两位，一个行商出身，一个是胥吏之子，却都爬到了朝廷正二品的高位kaxi6 ¤com若不是穿越者独裁，是怎么都不可能的kaxi6 ¤com
而李国俊以前的两个副手，王华钦出任税务总局局长，专职负责大明所有税收的收取kaxi6 ¤com王执则接任工商总局局长kaxi6 ¤com原户部尚书王绍徵平级调动到农业部，专管农业kaxi6 ¤com随同陈子壮一起在奥斯曼出任使节多年的崔呈秀，出任商务部尚书kaxi6 ¤com
从以前户部里拆分出来的还有一个部门：审计署kaxi6 ¤com是专门对政府部门进行经济监督的kaxi6 ¤com朱由栋给这个部门配上了让全国官员心惊肉跳的主官：信王朱由检kaxi6 ¤com
教育部尚书自然是喜欢教书育人的张以诚kaxi6 ¤com而兼管理藩院的外交部尚书，则交给了陈子壮kaxi6 ¤com
国防部尚书仍然是杨镐：大明这会的国防部其实就是一个军队后勤部kaxi6 ¤com而独立出来的负责征兵、建立后备役，安置退役士兵，保障将士利益的兵役总局第一任局长，则是朱由栋小时候的侍卫长，原大明皇家军事学院的院长，李世忠kaxi6 ¤com
第一任公安部尚书，是从方山学校毕业后就一直在各地做推官的简王朱由㰒kaxi6 ¤com
司法部的主要职责是负责监狱管理、犯人劳教、诉讼、普法以及未来的大明司法考试等事项kaxi6 ¤com经过大家反复会商，最后定下，由当年在孔府案中表现积极的王在晋出任第一任司法部尚书kaxi6 ¤c